智能体百宝箱

蛋白质工具

AGENT
bioemu

bioemu

蛋白结构采样工具bioemu

Protein Structure Sampling
AGENT
Protenix

Protenix

分子结构预测工具Protenix

Molecular Structure Prediction
AGENT
ProtSSN

ProtSSN

蛋白突变预测工具ProtSSN

Mutation Effect Prediction
AGENT
Foldseek

Foldseek

蛋白结构比对和搜索工具Foldseek

Protein Structure Search+1

AI助手

AGENT
SciCat

SciCat

SciCat: 科研人自己的猫娘

AGENT
智算

智算

AI科学助手

pythontool+3

量子化学/第一性原理

AGENT
Reno Agent

Reno Agent

Tensor Network agent based on Renormalizer

quantumdmrg+2
AGENT
ABACUS

ABACUS

原子算筹:国产开源第一性原理计算软件

First-Principle Calculation+1
AGENT
REST

REST

REST: Rust-based Electronic Structure Toolkit for molecular quantum chemistry

Quantum Chemistry+1

化学工具

AGENT
ADMET-AI

ADMET-AI

ADMET 性质预测工具

Drug Discovery
AGENT
RDKit

RDKit

化学信息学工具包

Chemiformatics
AGENT
aizynthfinder

aizynthfinder

逆合成路线预测工具

Chemiformatics
AGENT
MolSculptor

MolSculptor

MolSculptor 多靶点药物设计工具

Drug Discovery
AGENT
OpenBabel

OpenBabel

化学信息学工具包

Chemiformatics

分子动力学

AGENT
LAMMPS-CHON-聚合物模拟

LAMMPS-CHON-聚合物模拟

分子动力学模拟(LAMMPS),用于CHON化合物模拟任务(例如聚合物)

Molecular DynamicsLAMMPS+1
AGENT
SPONGE

SPONGE

GPU加速的分子动力学模拟工具包

Molecular Dynamics

分子对接

AGENT
Deep Site Docking Pose (DSDP)

Deep Site Docking Pose (DSDP)

GPU 加速的分子对接工具包

Molecular Docking

机器学习势

AGENT
MLIP-Agent

MLIP-Agent

面向 MACE 和 DP/DPMD 的 MLIP 工作流助手,支持结构检查、弛豫、分子动力学、表面/吸附、反应、声子、热学分析、弹性、EOS 和 IR。

mlipmace+5

其他

AGENT
PySCF

PySCF

基于Python语言的量子化学计算软件包

Quantum Chemistry
AGENT
packmol-agent

packmol-agent

support flexible packmol generation

pythontool
AGENT
GPU4PySCF

GPU4PySCF

GPU加速的量子化学计算软件包

Quantum Chemistry
AGENT
hot_spot_residue_identifier

hot_spot_residue_identifier

Identify the hotspot residues of a given target in PDB